儿内科是目前有床位150张，儿科门急诊工作量10万人次/年，住院约8000人次/年。特色专科：新生儿、呼吸、消化、心血管、神经、内分泌、中医儿科、儿童重症监护室等。其中新生儿科是江苏省妇幼保健重点学科、首批省级新生儿危急重症救治中心、国家儿科住院医师规范化培训协同基地、南通市临床医学重点学科、重点专科、“十三五”医学重点专科、国家级/省级优质护理示范病区。新生儿年出院病人2000人次以上，危重症抢救成功率95%以上。与南通120联动，对危重患儿开辟绿色通道， 24小时全市范围转运。2018年成立南通首家母乳库中心，开展鸟巢式护理，袋鼠式护理，成功抢救胎龄24⁺⁵周双胎儿，达省内领先水平。在危重新生儿的综合救治中，从“产前-产时-产后”对高危儿进行系统管理，制定个性化治疗方案，实施超早期的早产儿康复训练计划，制定规范系统的随访计划。小儿心内科与上海复旦大学附属儿科医院联合，已成功开展先心介入手术，给南通人民带来福音。小儿神经内科对癫痫、惊厥病人进行规范化治疗，年出院病人300人次以上，是南通市重点学科建设单位。PICU自2016年起已救治危重患儿近200例，在南通地区占一席之地。联合产前诊断、新生儿疾病筛查，对疑难罕见疾病精准治疗。中医儿科已经开展三九贴、三伏贴、针灸、推拿、中药穴位敷贴等治疗。科室医护96人，其中医师36名，高级职称7人，中级职称19人，硕士学历17人。高级护理人员3名，危重症专科护士7名。科室负责人在江苏省妇幼保健协会新生儿质量控制分会任职，参与新生儿质量控制管理。已经立项包括国家自然科学基金在内的各级科研课题10余项，省级新技术引进奖二等奖1项、市级新技术引进奖项7项、实用型专利10项。科室每年举办新生儿复苏培训和危急重症抢救新技术培训等继续教育学习班。